二氧化氯是在1911年由科学家发现的一种物质，当时由于发现这种物质具有极强的氧化性，所以被猜测其具有杀菌的能力，但是由于生产工艺的限制，一直没有大规模的投入使用。直到次氯酸钠的大规模生产以后，人们才大规模的将二氧化氯用在杀菌消毒的用途上。我国开始应用二氧化氯技术是在80年代最先有广东省引入了二氧化氯的生产技术，随后这种技术在上海市得到了推广，最后卫生部在2000年提出，逐步使用二氧化氯代替氯气消毒的建议。

　　在20世纪中前期，当大家还没有认识到二氧化氯的优越性之前，氯气在消毒行业得到了很大程度上的应用，这是因为氯气按当时的条件可以很大程度的杀灭水中的绝大多数的致病微生物，而且因为氯气的生产成本比较低廉，所以它在工业上得到了极大的应用。但是随着医学研究的不断深入，科学家们陆续都发现了氯气在水中可以以游离态的氯分子形式存在，但是氯分子可以与水中的有机物发生反应，并生成对人体有害的物质，这种物质对人体的短期没有大的影响，但是随着在人体中的积累，它可以对人体的各方面的性能产生影响，甚至可以诱发癌症。当深入认识到了氯气的危害时，世界环保联盟提出了全面禁止使用氯气，并在全世界各地逐渐的普及以二氧化氯为消毒剂的建议。目前，二氧化氯已经得到了世界卫生组织(WHO)的认可。

　　二氧化氯消毒剂即可用于水池消毒，亦可用于食品消毒，不过需要提醒的是，二氧化氯消毒剂是用于食品的消毒，不是食品的添加剂。

　　二氧化氯可以破坏单细胞病毒、细菌附着在细胞膜的活化酶，而多细胞生物的酶是在细胞壁上的，细胞膜对二氧化氯的破坏性形成了良好的阻隔作用，所以二氧化氯可以用来单独杀灭水中的病毒、细菌，而不对人体造成危害，可以作为一种广谱的消毒杀菌剂来使用。